La disinstallazione della procedura iDeskmanager avviene da Pannello di controllo - Programmi e funzionalità. L’istanza da rimuovere è denominata al pari del nome scelto per le icone in Start ed eventualmente per il Desktop. Al completamento dell’operazione sono rimosse anche le directory d’installazione.

Nel caso specifico di piattaforma con UAC attivo, la procedura acquisisce autonomamente privilegi elevati da amministratore.

Senza UAC attivo, risulta necessario che l’utente appartenga al gruppo Administrator di Windows ed abbia i permessi di scrittura e cancellazione sia nella directory base di sistema operativo (%SYSTEMROOT%, es. C:\Windows) sia nella directory d’installazione iDesk.